mirror of
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synced 2024-12-25 08:13:29 +03:00
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23 KiB
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23 KiB
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language: R
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contributors:
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- ["e99n09", "http://github.com/e99n09"]
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- ["isomorphismes", "http://twitter.com/isomorphisms"]
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translators:
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- ["Anne-Catherine Dehier", "https://github.com/spellart"]
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filename: learnr-fr.r
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R est un langage de programmation statistique. Il dispose de nombreuses
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librairies pour le téléchargement et le nettoyage des ensembles de données,
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l'exécution de procédures statistiques, et pour faire des graphiques.
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On peut également exécuter les commmandes R à l'aide d'un document LaTeX.
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```r
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# Les commentaires commencent avec des symboles numériques.
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# Il n'est pas possible de faire des commentaires multilignes,
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# mais on peut superposer plusieurs commentaires comme ceci.
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# Sur Windows ou Mac, taper COMMAND-ENTER pour exécuter une ligne
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# Les choses que vous pouvez faire sans rien comprendre à la programmation
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# In this section, we show off some of the cool stuff you can do in
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# Dans cette section, nous vous montrons quelques trucs cools que vous
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# pouvez faire avec R sans rien comprendre à la programmation.
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# Ne vous inquiétez pas si vous ne comprenez pas tout ce que le code fait.
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# Profitez simplement !
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data() # parcours les ensembles de données préchargées
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data(rivers) # obtiens celui-ci: "Lengths of Major North American Rivers"
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ls() # notez que "rivers" apparaît maintenant dans votre espace de travail
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head(rivers) # Jetez un coup d'oeil à l'ensemble de données
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# 735 320 325 392 524 450
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length(rivers) # Combien de rivers ont été mesurées ?
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# 141
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summary(rivers) # quelles sont les statistiques sommaires ?
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# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
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# 135.0 310.0 425.0 591.2 680.0 3710.0
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# Fait un diagramme à tiges et à feuilles (visualisation de données de
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types histogramme)
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stem(rivers)
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# Le point décimal est de 2 chiffres à droite du |
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#
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# 0 | 4
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# 2 | 011223334555566667778888899900001111223333344455555666688888999
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# 4 | 111222333445566779001233344567
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# 6 | 000112233578012234468
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# 8 | 045790018
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# 10 | 04507
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# 12 | 1471
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# 14 | 56
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# 16 | 7
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# 18 | 9
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# 20 |
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# 22 | 25
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# 24 | 3
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# 26 |
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# 28 |
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# 30 |
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# 32 |
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# 34 |
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# 36 | 1
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stem(log(rivers)) # Notez que les données ne sont ni normales ni lognormales !
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# Prenez-ça les fondamentalistes, la courbe en cloche
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# Le point décimal est à 1 chiffre à gauche du |
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#
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# 48 | 1
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# 50 |
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# 52 | 15578
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# 54 | 44571222466689
|
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# 56 | 023334677000124455789
|
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# 58 | 00122366666999933445777
|
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# 60 | 122445567800133459
|
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# 62 | 112666799035
|
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|
# 64 | 00011334581257889
|
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|
# 66 | 003683579
|
||
|
# 68 | 0019156
|
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# 70 | 079357
|
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# 72 | 89
|
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|
# 74 | 84
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|
# 76 | 56
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# 78 | 4
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# 80 |
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# 82 | 2
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# Fais un histogramme :
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hist(rivers, col="#333333", border="white", breaks=25) # amusez-vous avec ces parenthèses
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hist(log(rivers), col="#333333", border="white", breaks=25) # vous ferez plus de tracés plus tard
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# Ici d'autres données nettes qui viennent préchargées. R en a des tonnes.
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data(discoveries)
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plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, xlab="Year",
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main="Number of important discoveries per year")
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plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, type = "h", xlab="Year",
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main="Number of important discoveries per year")
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# Plutôt que de laisser l'ordre par défaut (par années)
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# Nous pourrions aussi trier pour voir ce qu'il y a de typique
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sort(discoveries)
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# [1] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2
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# [26] 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3
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# [51] 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4
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# [76] 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 8 9 10 12
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stem(discoveries, scale=2)
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#
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# Le point décimale est à la |
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#
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# 0 | 000000000
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# 1 | 000000000000
|
||
|
# 2 | 00000000000000000000000000
|
||
|
# 3 | 00000000000000000000
|
||
|
# 4 | 000000000000
|
||
|
# 5 | 0000000
|
||
|
# 6 | 000000
|
||
|
# 7 | 0000
|
||
|
# 8 | 0
|
||
|
# 9 | 0
|
||
|
# 10 | 0
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|
# 11 |
|
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|
# 12 | 0
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max(discoveries)
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# 12
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summary(discoveries)
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# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
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# 0.0 2.0 3.0 3.1 4.0 12.0
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# Lance un dès quelques fois
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round(runif(7, min=.5, max=6.5))
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# 1 4 6 1 4 6 4
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# Vos numéros diffèreront des miens à moins que nous mettions le même random.seed(31337)
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# Dessine à partir d'une normale Gaussienne 9 fois
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rnorm(9)
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# [1] 0.07528471 1.03499859 1.34809556 -0.82356087 0.61638975 -1.88757271
|
||
|
# [7] -0.59975593 0.57629164 1.08455362
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##################################################
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# les types de données et l'arithmétique de base
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# Now for the programming-oriented part of the tutorial.
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# In this section you will meet the important data types of R:
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# integers, numerics, characters, logicals, and factors.
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# There are others, but these are the bare minimum you need to
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# get started.
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# Maintenant pour la partie orientée programmation du tutoriel.
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# Dans cette section vous rencontrerez les types de données importants de R :
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# les entiers, les numériques, les caractères, les logiques, et les facteurs.
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# LES ENTIERS
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# Les entiers de mémoire longue sont écrit avec L
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5L # 5
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class(5L) # "integer"
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# (Essayez ?class pour plus d'information sur la fonction class().)
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# Avec R, chaque valeur seule, comme 5L, est considéré comme un vecteur de longueur 1
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length(5L) # 1
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# On peut avoir un vecteur d'entiers avec une longueur > 1 aussi :
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c(4L, 5L, 8L, 3L) # 4 5 8 3
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length(c(4L, 5L, 8L, 3L)) # 4
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||
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class(c(4L, 5L, 8L, 3L)) # "integer"
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# LES NUMÉRIQUES
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# Un "numeric" est un nombre à virgule flottante avec une double précision
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5 # 5
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class(5) # "numeric"
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# Encore une fois, tout dans R est un vecteur ;
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# Vous pouvez faire un vecteur numérique avec plus d'un élément
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c(3,3,3,2,2,1) # 3 3 3 2 2 1
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# Vous pouvez utiliser la notation scientifique aussi
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5e4 # 50000
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6.02e23 # nombre d'Avogadro
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1.6e-35 # longueur de Planck
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# Vous pouvez également avoir des nombres infiniments grands ou petits
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class(Inf) # "numeric"
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class(-Inf) # "numeric"
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# Vous pouvez utiliser "Inf", par exemple, dans integrate(dnorm, 3, Inf);
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# Ça permet d'éviter des tableaux Z-scores.
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# ARITHMÉTIQUES DE BASE
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# Vous pouvez faire de l'arithmétique avec des nombres
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# Faire des opérations arithmétiques en mixant des entiers et des numériques
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# donne un autre numérique
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10L + 66L # 76 # un entier plus un entier donne un entier
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53.2 - 4 # 49.2 # un numérique moins un numérique donne un numérique
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|
2.0 * 2L # 4 # un numérique multiplié par un entier donne un numérique
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3L / 4 # 0.75 # un entier sur un numérique donne un numérique
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|
3 %% 2 # 1 # le reste de deux numériques est un autre numérique
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|
# Les opérations arithmétiques illégales rapportent un "Not A Number" :
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0 / 0 # NaN
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class(NaN) # "numeric"
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# You can do arithmetic on two vectors with length greater than 1,
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# Vous pouvez faire des opérations arithmétiques avec deux vecteurs d'une
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# longueur plus grande que 1, à condition que la longueur du plus grand
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# vecteur soit un multiple entier du plus petit
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c(1,2,3) + c(1,2,3) # 2 4 6
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# LES CARACTÈRES
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# Il n'y a pas de différences entre les chaînes de caractères et les caractères en R
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"Horatio" # "Horatio"
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class("Horatio") # "character"
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class('H') # "character"
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# Ceux-ci sont tous les deux des vecteurs de longueur 1
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|
# Ici un plus long :
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||
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c('alef', 'bet', 'gimmel', 'dalet', 'he')
|
||
|
# =>
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||
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# "alef" "bet" "gimmel" "dalet" "he"
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||
|
length(c("Call","me","Ishmael")) # 3
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|
# Vous pouvez faire des expressions rationnelles sur les vecteurs de caractères :
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|
substr("Fortuna multis dat nimis, nulli satis.", 9, 15) # "multis "
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|
gsub('u', 'ø', "Fortuna multis dat nimis, nulli satis.") # "Fortøna møltis dat nimis, nølli satis."
|
||
|
# R possède plusieurs vecteurs de caractères préconstruits :
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letters
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||
|
# =>
|
||
|
# [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r" "s"
|
||
|
# [20] "t" "u" "v" "w" "x" "y" "z"
|
||
|
month.abb # "Jan" "Feb" "Mar" "Apr" "May" "Jun" "Jul" "Aug" "Sep" "Oct" "Nov" "Dec"
|
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# LES TYPES LOGIQUES
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# En R, un "logical" est un booléen
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class(TRUE) # "logical"
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class(FALSE) # "logical"
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# Leur comportement est normal
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TRUE == TRUE # TRUE
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TRUE == FALSE # FALSE
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FALSE != FALSE # FALSE
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FALSE != TRUE # TRUE
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# Les données manquantes (NA) sont logiques également
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class(NA) # "logical"
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# Ici nous avons un vecteur de type logique avec plusieurs éléments :
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c('Z', 'o', 'r', 'r', 'o') == "Zorro" # FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
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c('Z', 'o', 'r', 'r', 'o') == "Z" # TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE
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# LES FACTEURS
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# The factor class is for categorical data
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# La classe facteur sert aux données catégorielles
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# les facteurs peuvent être ordonnés (comme les niveaux de catégorie d'enfants)
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# ou non ordonnés (comme le sexe)
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factor(c("female", "female", "male", NA, "female"))
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||
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# female female male <NA> female
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# Les niveaux : female male
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|
# Les "levels" sont les valeurs que les données catégorielles peuvent prendre
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|
# Notez que cette donnée manquante n'entre pas dans le niveau
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levels(factor(c("male", "male", "female", NA, "female"))) # "female" "male"
|
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|
# Si le vecteur de facteurs a une longueur 1, ses niveaux seront de longueur 1 également
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|
length(factor("male")) # 1
|
||
|
length(levels(factor("male"))) # 1
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||
|
# On rencontre communément des facteurs dans des trames de données,
|
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|
# une structure de données que nous couvrirons plus tard
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|
data(infert) # "Infertility after Spontaneous and Induced Abortion"
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|
levels(infert$education) # "0-5yrs" "6-11yrs" "12+ yrs"
|
||
|
|
||
|
# NULL
|
||
|
# "NULL" est bizarre ; on l'utilise pour effacer un vecteur
|
||
|
class(NULL) # NULL
|
||
|
parakeet
|
||
|
# =>
|
||
|
# [1] "beak" "feathers" "wings" "eyes"
|
||
|
parakeet <- NULL
|
||
|
parakeet
|
||
|
# =>
|
||
|
# NULL
|
||
|
|
||
|
# LES CONTRAINTES DE TYPES
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|
# Les contraintes de types servent à forcer une valeur à prendre un type différent
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|
as.character(c(6, 8)) # "6" "8"
|
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|
as.logical(c(1,0,1,1)) # TRUE FALSE TRUE TRUE
|
||
|
# Si vous mettez des éléments de différents types dans un vecteur, des coercitions bizarres se produisent :
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|
c(TRUE, 4) # 1 4
|
||
|
c("dog", TRUE, 4) # "dog" "TRUE" "4"
|
||
|
as.numeric("Bilbo")
|
||
|
# =>
|
||
|
# [1] NA
|
||
|
# Message d'avertissement :
|
||
|
# NAs est introduit par coercition
|
||
|
|
||
|
# Notez également : ce n'étaient que des types de données basiques
|
||
|
# Il y a beaucoup d'autres types de données, comme pour les dates, les séries de temps, etc ...
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
##################################################
|
||
|
# Variables, boucles , if/else
|
||
|
##################################################
|
||
|
|
||
|
# Une variable est comme une boîte où l'on garde une valeur pour l'utiliser plus tard.
|
||
|
# Nous appellons ça "assigner" une valeur à une variable.
|
||
|
# Avoir des variables nous permets d'écrire des boucles, des fonctions, et
|
||
|
# des instructions conditionnelles (if/else)
|
||
|
|
||
|
# LES VARIABLES
|
||
|
# Beaucoup de façons d'assigner des choses :
|
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|
x = 5 # c'est possible
|
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|
y <- "1" # c'est préféré
|
||
|
TRUE -> z # ça marche mais c'est bizarre
|
||
|
|
||
|
# LES BOUCLES
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||
|
# Il y a les boucles for :
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||
|
for (i in 1:4) {
|
||
|
print(i)
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||
|
}
|
||
|
# Il y a les boucles while :
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|
a <- 10
|
||
|
while (a > 4) {
|
||
|
cat(a, "...", sep = "")
|
||
|
a <- a - 1
|
||
|
}
|
||
|
# Gardez à l'esprit que les boucles for et while s'exécute lentement en R
|
||
|
# Des opérations sur des vecteurs entiers (ex un ligne entière, une colonne entière),
|
||
|
# ou la fonction apply()-type (nous en parlerons plus tard), sont préférés
|
||
|
|
||
|
# IF/ELSE
|
||
|
# Encore une fois assez standard
|
||
|
if (4 > 3) {
|
||
|
print("4 is greater than 3")
|
||
|
} else {
|
||
|
print("4 is not greater than 3")
|
||
|
}
|
||
|
# =>
|
||
|
# [1] "4 is greater than 3"
|
||
|
|
||
|
# LES FONCTIONS
|
||
|
# se définissent comme ceci :
|
||
|
jiggle <- function(x) {
|
||
|
x = x + rnorm(1, sd=.1) #add in a bit of (controlled) noise
|
||
|
return(x)
|
||
|
}
|
||
|
# Appelée comme n'importe quelle autre fonction R :
|
||
|
jiggle(5) # 5±ε. After set.seed(2716057), jiggle(5)==5.005043
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
###########################################################################
|
||
|
# Les structures de données : les vecteurs, les matrices, les trames de données et les tableaux
|
||
|
###########################################################################
|
||
|
|
||
|
# À UNE DIMENSION
|
||
|
|
||
|
# Commençons par le tout début, et avec quelque chose que vous connaissez déjà : les vecteurs.
|
||
|
vec <- c(8, 9, 10, 11)
|
||
|
vec # 8 9 10 11
|
||
|
# Nous demandons des éléments spécifiques en les mettant entre crochets
|
||
|
# (Notez que R commence à compter par 1)
|
||
|
vec[1] # 8
|
||
|
letters[18] # "r"
|
||
|
LETTERS[13] # "M"
|
||
|
month.name[9] # "September"
|
||
|
c(6, 8, 7, 5, 3, 0, 9)[3] # 7
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||
|
# Nous pouvons également rechercher des indices de composants spécifiques,
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|
which(vec %% 2 == 0) # 1 3
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||
|
# Récupèrer seulement quelques premières ou dernières entrées du vecteur,
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head(vec, 1) # 8
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||
|
tail(vec, 2) # 10 11
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||
|
# ou trouver si un certaine valeur est dans le vecteur
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|
any(vec == 10) # TRUE
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# Si un index "dépasse" vous obtiendrez NA :
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vec[6] # NA
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# Vous pouvez trouver la longueur de votre vecteur avec length()
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length(vec) # 4
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# Vous pouvez réaliser des opérations sur des vecteurs entiers ou des sous-ensembles de vecteurs
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vec * 4 # 16 20 24 28
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||
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vec[2:3] * 5 # 25 30
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||
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any(vec[2:3] == 8) # FALSE
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||
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# Et R a beaucoup de fonctions préconstruites pour résumer les vecteurs
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mean(vec) # 9.5
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var(vec) # 1.666667
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sd(vec) # 1.290994
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max(vec) # 11
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min(vec) # 8
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sum(vec) # 38
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# Quelques fonctions préconstruites sympas supplémentaires :
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5:15 # 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
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|
seq(from=0, to=31337, by=1337)
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# =>
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|
# [1] 0 1337 2674 4011 5348 6685 8022 9359 10696 12033 13370 14707
|
||
|
# [13] 16044 17381 18718 20055 21392 22729 24066 25403 26740 28077 29414 30751
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# À DEUX DIMENSIONS (TOUT DANS UNE CLASSE)
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# Vous pouvez faire une matrice de toutes les entrées du même type comme ceci :
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mat <- matrix(nrow = 3, ncol = 2, c(1,2,3,4,5,6))
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mat
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||
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# =>
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||
|
# [,1] [,2]
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||
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# [1,] 1 4
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||
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# [2,] 2 5
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||
|
# [3,] 3 6
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||
|
# Différemment du vecteur, la classe d'une matrice est "matrix",peut importe ce qu'elle contient
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class(mat) # => "matrix"
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# Demander la première ligne
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mat[1,] # 1 4
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# Réaliser une opération sur la première colonne
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3 * mat[,1] # 3 6 9
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# Ask for a specific cell
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mat[3,2] # 6
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|
# Transposer la matrice entière
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t(mat)
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||
|
# =>
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||
|
# [,1] [,2] [,3]
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# [1,] 1 2 3
|
||
|
# [2,] 4 5 6
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||
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|
||
|
# La multiplication de matrices
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mat %*% t(mat)
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|
# =>
|
||
|
# [,1] [,2] [,3]
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||
|
# [1,] 17 22 27
|
||
|
# [2,] 22 29 36
|
||
|
# [3,] 27 36 45
|
||
|
|
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|
# cbind() colle des vecteurs ensemble en colonne pour faire une matrice
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mat2 <- cbind(1:4, c("dog", "cat", "bird", "dog"))
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||
|
mat2
|
||
|
# =>
|
||
|
# [,1] [,2]
|
||
|
# [1,] "1" "dog"
|
||
|
# [2,] "2" "cat"
|
||
|
# [3,] "3" "bird"
|
||
|
# [4,] "4" "dog"
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||
|
class(mat2) # matrix
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|
# Encore une fois notez ce qui se passe !
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|
# Parce que les matrices peuvent contenir des entrées de toutes sortes de classes,
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|
# tout sera converti en classe caractère
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c(class(mat2[,1]), class(mat2[,2]))
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|
# rbind() colle des vecteurs ensemble par lignes pour faire une matrice
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|
mat3 <- rbind(c(1,2,4,5), c(6,7,0,4))
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||
|
mat3
|
||
|
# =>
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||
|
# [,1] [,2] [,3] [,4]
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||
|
# [1,] 1 2 4 5
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||
|
# [2,] 6 7 0 4
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|
# Ah, tout de la même classe. Pas de coercitions. Beaucoup mieux.
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# À DEUX DIMENSIONS (DE CLASSES DIFFÉRENTES)
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|
# Pour des colonnes de différents types, utiliser une trame de donnée
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# Cette structure de données est si utile pour la programmation statistique,
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# qu'une version a été ajoutée à Python dans le paquet "pandas".
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students <- data.frame(c("Cedric","Fred","George","Cho","Draco","Ginny"),
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|
c(3,2,2,1,0,-1),
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c("H", "G", "G", "R", "S", "G"))
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|
names(students) <- c("name", "year", "house") # name the columns
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||
|
class(students) # "data.frame"
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students
|
||
|
# =>
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|
# name year house
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|
# 1 Cedric 3 H
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# 2 Fred 2 G
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|
# 3 George 2 G
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|
# 4 Cho 1 R
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# 5 Draco 0 S
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# 6 Ginny -1 G
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class(students$year) # "numeric"
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class(students[,3]) # "factor"
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# Trouver les dimensions
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nrow(students) # 6
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ncol(students) # 3
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dim(students) # 6 3
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|
# La fonction data.frame() convertit les vecteurs caractères en vecteurs de facteurs
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|
# par défaut; désactiver cette fonction en règlant stringsAsFactors = FALSE
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|
# quand vous créer la data.frame
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|
?data.frame
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|
# Il y a plusieurs façons tortueuses de subdiviser les trames de données
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|
# toutes subtilement différentes
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|
students$year # 3 2 2 1 0 -1
|
||
|
students[,2] # 3 2 2 1 0 -1
|
||
|
students[,"year"] # 3 2 2 1 0 -1
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||
|
|
||
|
# Une version augmentée de la structure data.frame est data.table
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|
# Si vous travaillez avec des données volumineuses ou des panels, ou avez
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|
# besoin de fusionner quelques ensembles de données, data.table peut être
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|
# un bon choix. Ici un tour éclair :
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|
install.packages("data.table") # download the package from CRAN
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|
require(data.table) # load it
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|
students <- as.data.table(students)
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||
|
students # note the slightly different print-out
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||
|
# =>
|
||
|
# name year house
|
||
|
# 1: Cedric 3 H
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|
# 2: Fred 2 G
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|
# 3: George 2 G
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|
# 4: Cho 1 R
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|
# 5: Draco 0 S
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|
# 6: Ginny -1 G
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|
students[name=="Ginny"] # get rows with name == "Ginny"
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||
|
# =>
|
||
|
# name year house
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||
|
# 1: Ginny -1 G
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||
|
students[year==2] # get rows with year == 2
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||
|
# =>
|
||
|
# name year house
|
||
|
# 1: Fred 2 G
|
||
|
# 2: George 2 G
|
||
|
# data.table facilite la fusion entre deux ensembles de données
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||
|
# Faisons un autre data.table pour fusionner students
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founders <- data.table(house=c("G","H","R","S"),
|
||
|
founder=c("Godric","Helga","Rowena","Salazar"))
|
||
|
founders
|
||
|
# =>
|
||
|
# house founder
|
||
|
# 1: G Godric
|
||
|
# 2: H Helga
|
||
|
# 3: R Rowena
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||
|
# 4: S Salazar
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||
|
setkey(students, house)
|
||
|
setkey(founders, house)
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||
|
students <- founders[students] # merge the two data sets by matching "house"
|
||
|
setnames(students, c("house","houseFounderName","studentName","year"))
|
||
|
students[,order(c("name","year","house","houseFounderName")), with=F]
|
||
|
# =>
|
||
|
# studentName year house houseFounderName
|
||
|
# 1: Fred 2 G Godric
|
||
|
# 2: George 2 G Godric
|
||
|
# 3: Ginny -1 G Godric
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||
|
# 4: Cedric 3 H Helga
|
||
|
# 5: Cho 1 R Rowena
|
||
|
# 6: Draco 0 S Salazar
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||
|
|
||
|
# data.table facilite le sommaire des tableaux
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|
students[,sum(year),by=house]
|
||
|
# =>
|
||
|
# house V1
|
||
|
# 1: G 3
|
||
|
# 2: H 3
|
||
|
# 3: R 1
|
||
|
# 4: S 0
|
||
|
|
||
|
# Pour supprimer une colonne d'une data.frame ou data.table,
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||
|
# assignez-lui la valeur NULL
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|
students$houseFounderName <- NULL
|
||
|
students
|
||
|
# =>
|
||
|
# studentName year house
|
||
|
# 1: Fred 2 G
|
||
|
# 2: George 2 G
|
||
|
# 3: Ginny -1 G
|
||
|
# 4: Cedric 3 H
|
||
|
# 5: Cho 1 R
|
||
|
# 6: Draco 0 S
|
||
|
|
||
|
# Supprimer une ligne en subdivisant
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|
# En utilisant data.table :
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||
|
students[studentName != "Draco"]
|
||
|
# =>
|
||
|
# house studentName year
|
||
|
# 1: G Fred 2
|
||
|
# 2: G George 2
|
||
|
# 3: G Ginny -1
|
||
|
# 4: H Cedric 3
|
||
|
# 5: R Cho 1
|
||
|
# En utilisant data.frame :
|
||
|
students <- as.data.frame(students)
|
||
|
students[students$house != "G",]
|
||
|
# =>
|
||
|
# house houseFounderName studentName year
|
||
|
# 4 H Helga Cedric 3
|
||
|
# 5 R Rowena Cho 1
|
||
|
# 6 S Salazar Draco 0
|
||
|
|
||
|
# MULTI-DIMENSIONNELLE (TOUS ÉLÉMENTS D'UN TYPE)
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|
# Les arrays créent des tableaux de n dimensions
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|
# Tous les éléments doivent être du même type
|
||
|
# Vous pouvez faire un tableau à 2 dimensions (une sorte de matrice)
|
||
|
array(c(c(1,2,4,5),c(8,9,3,6)), dim=c(2,4))
|
||
|
# =>
|
||
|
# [,1] [,2] [,3] [,4]
|
||
|
# [1,] 1 4 8 3
|
||
|
# [2,] 2 5 9 6
|
||
|
# Vous pouvez utiliser array pour faire des matrices à 3 dimensions aussi
|
||
|
array(c(c(c(2,300,4),c(8,9,0)),c(c(5,60,0),c(66,7,847))), dim=c(3,2,2))
|
||
|
# =>
|
||
|
# , , 1
|
||
|
#
|
||
|
# [,1] [,2]
|
||
|
# [1,] 2 8
|
||
|
# [2,] 300 9
|
||
|
# [3,] 4 0
|
||
|
#
|
||
|
# , , 2
|
||
|
#
|
||
|
# [,1] [,2]
|
||
|
# [1,] 5 66
|
||
|
# [2,] 60 7
|
||
|
# [3,] 0 847
|
||
|
|
||
|
# LES LISTES (MULTI-DIMENSIONNELLES, ÉVENTUELLEMMENT DÉCHIRÉES, DE DIFFÉRENTS TYPES)
|
||
|
|
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|
# Enfin R a des listes (de vecteurs)
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||
|
list1 <- list(time = 1:40)
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|
list1$price = c(rnorm(40,.5*list1$time,4)) # random
|
||
|
list1
|
||
|
# Vous pouvez obtenir des éléments de la liste comme ceci
|
||
|
list1$time # one way
|
||
|
list1[["time"]] # another way
|
||
|
list1[[1]] # yet another way
|
||
|
# =>
|
||
|
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
|
||
|
# [34] 34 35 36 37 38 39 40
|
||
|
# Vous pouvez subdiviser les éléments d'une liste comme n'importe quel vecteur
|
||
|
list1$price[4]
|
||
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|
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|
# Les listes ne sont pas les structures de données les plus efficaces
|
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|
# pour travailler en R;
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|
# À moins d'avoir une très bonne raison, vous devriez appliquer data.frames
|
||
|
# Les listes sont souvent retournées par des fonctions qui effectuent des régressions linéaires
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|
|
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##################################################
|
||
|
# La famille de fonction apply()
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||
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##################################################
|
||
|
|
||
|
# Vous vous rappelez mat ?
|
||
|
mat
|
||
|
# =>
|
||
|
# [,1] [,2]
|
||
|
# [1,] 1 4
|
||
|
# [2,] 2 5
|
||
|
# [3,] 3 6
|
||
|
# Utilisez apply(X, MARGIN, FUN) pour appliquer la fonction FUN à la matrice X
|
||
|
# sur les lignes (MAR = 1) ou les colonnes (MAR = 2)
|
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|
# R fait FUN à chaque lignes (ou colonnes) de X, beaucoup plus rapidement
|
||
|
# qu'une bouce for ou while le ferait
|
||
|
apply(mat, MAR = 2, jiggle)
|
||
|
# =>
|
||
|
# [,1] [,2]
|
||
|
# [1,] 3 15
|
||
|
# [2,] 7 19
|
||
|
# [3,] 11 23
|
||
|
# D'autres fonctions : ?lapply, ?sapply
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|
# Ne soyez pas trop intimidé ; tout le monde reconnaît que c'est un peu déroutant
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# Le paque plyr vise à remplacer (et améliorer !) la famille *apply().
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install.packages("plyr")
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require(plyr)
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|
?plyr
|
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#########################
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|
# Charger des données
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#########################
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|
# "pets.csv" est un fichier sur internet
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|
# (mais il pourrait être tout aussi facilement sur votre ordinateur)
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pets <- read.csv("http://learnxinyminutes.com/docs/pets.csv")
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||
|
pets
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||
|
head(pets, 2) # first two rows
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||
|
tail(pets, 1) # last row
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||
|
|
||
|
# Pour sauver une trame de donnée ou une matrice en fichier .csv
|
||
|
write.csv(pets, "pets2.csv") # to make a new .csv file
|
||
|
# définir le répertoire de travail avec setwd(), le récupérer avec getwd()
|
||
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|
||
|
# Essayez ?read.csv et ?write.csv pour plus d'informations
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||
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|
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#########################
|
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|
# Les tracés
|
||
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#########################
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|
|
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|
# LES FONCTIONS DE TRACÉS PRÉCONSTRUITES
|
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|
# Les diagrammes de dispersion !
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|
plot(list1$time, list1$price, main = "fake data")
|
||
|
# Les régressions !
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linearModel <- lm(price ~ time, data = list1)
|
||
|
linearModel # sort le résultat de la régression
|
||
|
# Tracer une ligne de regression sur une tracé existant
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||
|
abline(linearModel, col = "red")
|
||
|
# Obtenir une variété de diagnostiques sympas
|
||
|
plot(linearModel)
|
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|
# Les histogrammes !
|
||
|
hist(rpois(n = 10000, lambda = 5), col = "thistle")
|
||
|
# Les diagrammes en bâtons !
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||
|
barplot(c(1,4,5,1,2), names.arg = c("red","blue","purple","green","yellow"))
|
||
|
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|
# GGPLOT2
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|
# Mais ceux-ci ne sont même pas les plus jolis tracés de R
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|
# Essayez le paquet ggplot2 pour d'avantages de graphiques meilleurs
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install.packages("ggplot2")
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require(ggplot2)
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?ggplot2
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pp <- ggplot(students, aes(x=house))
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|
pp + geom_histogram()
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ll <- as.data.table(list1)
|
||
|
pp <- ggplot(ll, aes(x=time,price))
|
||
|
pp + geom_point()
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||
|
# ggplot2 a une documentation excellente (disponible sur http://docs.ggplot2.org/current/)
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|
```
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|
## How do I get R?
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* Get R and the R GUI from [http://www.r-project.org/](http://www.r-project.org/)
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|
* [RStudio](http://www.rstudio.com/ide/) is another GUI
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